凹凸世界的创世神是一位很肆意随性的神明。他创造的世界生而不平等，只有参加凹凸大赛才有改变命运的机会。参赛者将得到大赛系统赐予的“特殊能力”，并锻炼运用各自的能力不断闯关战斗。只要能在凹凸大赛中获得最终的胜利，那么就能得到一切，并赐予你与“七神使”一样代神统治世界的权力。然而，这些都只是虚伪的表象……

凹凸大赛将迎来尾声，众人也由此走向命运的分叉口。金终于获知了关于姐姐的消息，格瑞也走到了真相面前，鬼狐找到了大赛的漏洞联合了嘉德罗斯小队与雷狮海盗团，安迷修的骑士之道上出现了曾经的引路人，艾比带着曾经的记忆开始寻找创世神失踪的真相，而两位监督天使各自带着神使的任务暗中行事……

故事以凹凸学园的初中部与高中部为舞台，描写围绕着刚升入高一的新生——金与他身边的同学之间，轻松有趣的搞笑向日常生活。凹凸学园里有着形形色色性格各异、古怪却也不失可爱的学生，而本作采用平行式的单元小故事讲述，用萌系Q版人物、声优的诙谐演出及别具一格的画面效果，将最轻松真实的学园生活展现给观众。

大家第二学年的故事。