故事发生在科技飞速发展的未来世界，彼时，人工智能机器人早已经不是罕见之物，正慢慢地融入人类的生活之中。高考落榜之后，十八岁的青年水柿司（内匠靖明 配音）在父母的帮助下来到了SAI社工作，SAI社的主要产品即是名为“Giftia”的人形智能机器人。
　　水柿司被安排到了终端部门工作，来到办公室后水柿司才发现，这个部门的主要职责竟然是回收即将报废的机器人。在这里，水柿司结识了名为艾拉（雨宫天 配音）的少女，她其实正是一名机器人，艾拉外表冷漠不善言其，却有着意外可爱的一面。就这样，水柿司和艾拉成为了工作中的搭档，两人之间渐渐产生了真挚的友谊。

　　故事以前作《科学小飞侠Crowds》的后续剧情展开。距离“立川事件”已经过了一年，当初贝尔库·卡切赋予尔乃美家累的力量“CROWDS”在日本首相菅山的推广之下已在人类社会当中广泛普及。然而仍然存在着对此感到不满的人们，此时菅山遭到不明人士的袭击，GATCHAMAN的全新战斗就此揭开序幕。

　　世界受“魔甲虫”威胁，大地遭其占据，人类如今只能住在天空中的浮游都市里。人类当中诞生出以魔力对抗“魔甲虫”的魔法师——空战魔导士。就读空战魔导士培育机构——学园浮游都市“密斯特岗”的彼方·英司，是被冠上“黑之剑圣”称号的S128特务小队菁英王牌。然而，如今他却被视为“特务小队的叛徒”而受到众人轻蔑、厌恶……某天，彼方被任命为连战皆败的E601小队教官。这支小队收容了三名个性特异的少女——？由叛徒与问题学生少女们展开的雄豪进击，现在启动

　　米朵（唐嫣 饰）是一个活泼开朗的女孩，然而，十分平凡的她却偏偏爱上了经营着钻石公司的总裁萧亮（郑智薰 饰）。自知自己和萧亮之间无论是样貌还是地位都十分不相称的米朵选择把这份感情深深埋藏在心底。
　　一场车祸中，米朵受伤了，之后，她接受了整容治疗手术，并最终拥有了完美的外貌。信心大增的米朵应聘进入了萧亮的公司，成为了设计师助理。随后接连而来的麻烦和挫折让米朵渐渐明白，外貌不过只是皮囊，里面装的究竟是稻草还是珠宝，这全要靠自己的努力。顿悟后的米朵开始苦心修炼，奋发图强，米朵并不知道的是，自己坚强勤奋的身影，正在渐渐吸引着萧亮的目光。

　　故事以主角辛纪元（黄日华饰）为主干，原是重案组督察，在经历儿子离奇猝死的打击后，触发了他能阅读及捕捉他人意识的潜能，过程中他出现了双重性格的征象，妻子及旁人都以为他患了精神病，其实他深信儿子是在“意识空间”被人杀死！元从此着力钻研“阅读人意识”的潜能，以私家侦探身份协助警方调查超自然案件，希望有一日查出在意识空间杀死儿子的真凶……而剧中一班主角都有异于常人的能力，他们把别人眼中“不正常”的特质，转化为不可思议的潜能，一起合作 屡破奇案。

　　故事以主角辛纪元（黄日华饰）为主干，原是重案组督察，在经历儿子离奇猝死的打击后，触发了他能阅读及捕捉他人意识的潜能，过程中他出现了双重性格的征象，妻子及旁人都以为他患了精神病，其实他深信儿子是在“意识空间”被人杀死！元从此着力钻研“阅读人意识”的潜能，以私家侦探身份协助警方调查超自然案件，希望有一日查出在意识空间杀死儿子的真凶……而剧中一班主角都有异于常人的能力，他们把别人眼中“不正常”的特质，转化为不可思议的潜能，一起合作 屡破奇案。