《剧场版 假面骑士剑 遗失的王牌》是平成假面骑士系列第四部剧场版，也是《假面骑士剑》的剧场版。4年前，连同小丑——相川始在内的53个不死生物都被封印了，身为假面骑士的剑崎一真、橘朔也、上城睦月三人，也终于可以不用再战斗了。他们和白井虎太郎、广濑栞等人，一起回归普通人的生活，各自寻求自己的新人生。但大家都没想到的是，在一段平静的日子后，不死生物居然又再度出现，并要对栗原天音下手！更让人难以相信的是，剑崎他们见到了以前从未见过的3位新假面骑士。3位新假面骑士告诉剑崎，“你们的时代已经结束了”。新时代已经不再需

一万年前的极限战争中，代表人类祖先的不死生物，封印了其他52只不死生物后，获得了最终胜利，人类从此得以在地球上繁衍生息。而21世纪的现在，封印被破解，这些不死生物再次苏醒了。为了阻止它们破坏人类的世界，BOARD（人类基盘史研究所）的所长乌丸开发出了假面骑士系统，用来封印那些不死生物。橘朔也和剑崎一真使用腰带变身成为假面骑士星币和假面骑士剑，就此展开了他们的英雄之战。故事初期的橘虽然有协助对抗不死生物，但他对剑等人也是敌视的态度。第三个假面骑士卡利斯——也就是相川始，这个亦正亦邪的角色让众人的立场发生了动

鬼，也被人称为音击战士。音击战士共分三类，分别是 “打击乐”、“管乐”以及“弦乐”。由于每种乐器针对的是不同类型的魔化魍，所以音击战士们都会独立行动。而专门负责支援这些鬼的人们，则在幕后组成了名为“猛士”的组织。这个组织的规模遍布全国，不同的分部在全国各地互相联系，交换魔化魍的情报。魔化魍出现后，“猛士”再派出鬼去消灭魔化魍，保护人们的安全。安达明日梦是名初三的学生，在报考学校和选择自己的理想中迷茫不已。他跟随母亲回老家参加法事的途中遇见了一个神秘的男子。神秘男子以远超常人的身手救下了一名即将掉入大海的小

一颗陨石坠落到地球的海洋中，造成海水蒸发，大片海洋消失。地球的气候因此出现异常，人类的生存环境不断恶化，地球上的树木枯萎，土地都变成了沙漠。更可怕的是，从那颗陨石中冒出了大量的外星生物异虫，它们有着强大的力量，并开始侵略人类的世界，让人类处在恐慌之中。为了对抗外敌的入侵，人类组成杰特这个特殊武力组织，并且花费人力物力开发出了假面骑士系统。然而，一些杰特的成员因不满杰特的做法，而选择脱离组织，成立了一个新的组织——新杰特。杰特和新杰特冲突不断，在一次杰特与新杰特的对抗中，一个神秘的男子天道总司出现了，他拥有

在未知生命体全部被消灭后的两年，人类迎来了短暂的和平。但海滩上突然出现的神秘欧帕兹，打破了这一和平。城市中再度出现了人类离奇死亡的案件，这次残杀人们的凶手是新的敌人——不明物体。它们拥有着人类无法匹敌的神秘力量，就连专门为之成立的G3小队也对它们毫无办法。失去记忆的开朗少年津上翔一，暂住在美杉教授家中，与美杉教授的侄女风谷真鱼、儿子美杉太一一起生活。但隐藏在翔一天真笑容背后的，其实是神秘的英雄——假面骑士亚极陀。每当不明物体出现残杀人类时，他便会受到感应前去消灭它们。愈发强大的不明物体、津上翔一过去的记忆

一个倒霉到家的少年野上良太郎，因为意外被不良少年们缠上，也因此无意间捡到了叶奈所遗失的通行证，路上又被异魔神悄悄附身。机缘巧合下良太郎打开了通往时间列车的门，并且遇上了列车员直美却觉得没有异状..... 之后叶奈告诉良太郎关于特异点以及电王的事情，他们遇上了被异魔神附身的不良少年...良太郎与众异魔神共同战斗、搞笑、悲伤的故事就从一句"本大爷登场"展开。

2002年日本发生多宗奇怪的人口失踪案，实习记者城户真司为了调查此事，前往其中一个受害者的家中调查，并在房间内发现了一个名为卡片套匣的道具。为了阻止镜中怪物袭击人类，真司情急之下使用卡片套匣的力量变身为假面骑士前往了怪物所在的镜中世界，并认识了另一位假面骑士秋山莲和神崎士郎的妹妹神崎优衣。随后真司才得知了卡片套匣的秘密以及围绕着神崎士郎所进行的13位假面骑士之间围绕着自己愿望的战斗——最后活着的假面骑士可以实现自己的愿望。 在与镜中怪物订下契约后，成为假面骑士龙骑的城户真司决心为了消灭怪物

夏目教授带着他的考古团队，在长野县九郎岳的一处神秘遗迹里，发现了一口神秘的棺材。当他们打开尘封的棺盖后，释放出了恐怖的怪物。苏醒的怪物灭掉了整个考古团队的人，随后，就消失不见了。这件事发生后，就开始了出现了一系列的怪事，可怕的未知生命体接二连三地出现。立志要守护大家笑容的五代雄介，在目睹了古朗基一号的暴行后，他决定戴上腰带，成为假面骑士空我。

在某个城市中存在着不为人知的被称为Amazon的吞噬人类的异形的存在。它们的数量，竟达到4000只。制造出这个怪物的元凶正是野座间制药公司！命令名下的野座间Peston Service驱除班秘密处理“Amazon”。就是在这种情况下，在清洁干净的房屋中一步也不出去的平稳生活着的青年水泽悠和只靠野生的直觉和战斗力的像野兽一样的活着的男人鹰山仁相识，慢慢懂得了在“Amazons”的激烈的生存斗争中生存下去的故事。

在令和时代，镇上的中华料理店来了一位帮手机器人小露宝，小露宝去给龙卷风婆婆送担担面时把汤汁给洒了，从而引发了一系列的骚乱。