影片根据兵器真人化游戏《刀剑乱舞ONLINE》改编，刀剑男士们将介入织田信长、丰臣秀吉的“本能寺之变”。

明朝万历年间，镇国之宝金龙剑不翼而飞。该宝剑剑气锋利，五步之内能令人一命呜呼。七百年来始终深藏宫中，从未出鞘，历代君王视同镇国玉玺珍藏。朝廷布下天罗地网搜寻宝剑的下落，查清宝剑为飞天貂狐刘天霸盗取，而刘天霸又被独行太岁所杀，夺走了宝剑。几经辗转，只知道在昆仑山脉一地。宝剑丢失的消息很快在江湖上传开，许多野心之徒试图夺得宝剑，称霸武林，为此不惜大开杀戒。

本片由何梦华导演，郑佩佩与岳华领衔主演。故事讲述，铁臂金刚方宁、方静押送赈银救济黄河灾民，途中受到盗寇韩世雄（黄宗迅）和韦通明（李允中）的突袭，全家老少遭杀害，惟稚女方瑛琪为玄真道长（顾文宗）救出，抱入深山抚养。瑛琪（郑佩佩）长成後，尽得玄真道长武功真传。其时金兵图大举进犯中原，玄真道长授瑛琪一剑一信，著其下山投效义军首领夏子龙（房勉）……

严太师遇刺毙命，护卫范义凭凶器判断刺客为寇英。寇英取得遇害县官身上的公文，得以入城，却仍为范义捉拿，幸得酒店店主的女儿，自认寇英是其表哥，寇英才幸免被捕。其后范义遭假扮成寇英的寨主袭击，而救回他的竟是……

忠臣宋沅被奸相贾守道陷害入狱，只有携先皇所赐的“免死铁券”上京伸冤，方可免罪。贾守道派出锦衣卫高思贤搜夺铁券，以置宋沅于死地。宋妻及女宋洁将“免死铁券”藏于琵琶中，沿途卖唱掩饰。无赖窑工吴三得知宋氏母女的真正身份，心想利用她们换贵官高禄，将高思贤引来御窑，混乱中“免死铁券”被做在砖内，却无人知晓。

沈冰红幼时目击父母被高允及结拜弟兄葛鸿、童洪、西门杀害，双脚更被冻至残废；长大后她练就非凡武功，矢志复仇。后沈冰红与高允次子高天英结识，高天英虽知沈冰红为报仇而来，却对她的遭遇非常同情，主动为她治好脚疾，此事引起童洪父女的不满。

九姑娘之兄巴杰勾结恶虎村恶霸胡蛟，图劫镖银，被‘铁沙掌’骆宏勋打伤。胡蛟恐事发后被巴家追究，下毒将巴杰毒毙，嫁祸骆宏勋，巴家上下誓欲杀死骆报仇……

女侠明珠的师父遭黑虎帮歹徒偷袭重伤，临终嘱往找故友之女青青，探问失踪财宝。歹徒偷听得遗言，先去劫赴青青，途遇“大罗剑侠”周应龙怒打不平。

江湖出现一贫僧打扮名唤小毒龙之杀手，嫉恶如仇，专杀江湖败类。她乃大悲寺疯僧之门徒，亦即‘毒龙剑’的传人李宝珠；她独来独往神出鬼没，歹徒闻风丧胆。她身背父仇，待中秋与仇人在十字坡一决生死。陈仕伦为李之表哥，乃铁扇子之高徒，率十字坡乡民严阵以待，助李抗敌……