怪兽在一个工业园里大量出现！弦人队长率领特怪对分队迎击怪兽，但它们还是接二连三地冒出来。发生怪兽灾害的工业园或许和专门处理怪兽残骸的企业内克洛马斯之间存在某种特殊的关系，特怪对分队立马找到了内克洛马斯的CEO真伏博士。内克洛马斯的研究所现在正在研究的东西叫做“达姆多可辛”，这种东西触及到了生命的根源，可以实现生物的长生不死，研发马上就要完成了。就在这时，自称宇宙霸主的达姆诺星人突然出现在众人面前。“达姆多可辛”的储藏柜也同时遭到破坏，这东西将研究所里的怪兽样本全部吸收，变成了恐怖的怪兽“妖骸魔兽贡基尔刚”

在全球怪物灾难爆发后，世界各国于1966年成立了地球防卫队“GGF”，以应对来自地球内外的怪物和外星生命的袭击。如今，人类对自然界的破坏和全球变暖现象日益严重。 一天晚上，宇宙甲壳怪兽巴赞加出现了。地球防卫队的清理行动遇到了困难，比留间弦人领导的特殊部队陷入了绝望的境地。 这时，一个神秘的巨人带着耀眼的光芒降临了。 这就是几十年前就在宇航员之间流传的，未经确认的大型宇宙人，代号——“奥特曼”。之后，弦人被传唤到指挥中心，突然接到成为特殊怪兽应对分遣队“SKaRD”指挥官的任务。SKaRD是一支秘密组织的特

两位特殊部队的队员坐在运输机内，盯着监控的屏幕。突然一声警报响起，系统检测到有怪兽出现。这时候特殊部队队员比留间弦人下达了新的指令，弦人命令所有人按照预案去指定地点集合。一头来自宇宙的怪兽甲壳怪兽从天而降，巨大的冲击力给城市带来了很大的破坏。地面防卫部队与怪兽展开了激烈交战。怪兽的肆意破坏摧毁了很多大楼，怪兽出现的地方化为了一片火海。弦人为了拯救还没有逃出的群众，独自冲入火海救人。弦人在救人过程中出现意外，关键时刻他体内涌现出一道神秘的光。新的奥特曼就此诞生了，新的奥特曼不光救下了弦人队长，还打败了怪兽。